177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3050 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  100 
 
 		 667 aa  1360    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.58 
 
 		 6885 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.65 
 
 		 2170 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  30.04 
 
 		 680 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  36.16 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  36.16 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34.29 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34.29 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  48 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  46.08 
 
 		 749 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  46.73 
 
 		 703 aa  81.6  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  35.87 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  48 
 
 		 660 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  46.24 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.78 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.16 
 
 		 809 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  35.59 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  51.22 
 
 		 973 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  35.59 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.08 
 
 		 1462 aa  77.8  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  35.03 
 
 		 455 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  34.04 
 
 		 235 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  35.71 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  47.87 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  46.91 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  45.36 
 
 		 458 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.88 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  49.48 
 
 		 1139 aa  72  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  43.48 
 
 		 552 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  48.84 
 
 		 1121 aa  71.2  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  48.84 
 
 		 1209 aa  70.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.54 
 
 		 2334 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  44.44 
 
 		 456 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  47.73 
 
 		 1137 aa  68.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  41.94 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.03 
 
 		 830 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  39.23 
 
 		 685 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  39.23 
 
 		 685 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.24 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  39.23 
 
 		 685 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  38.54 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 		 1448 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  40.4 
 
 		 1154 aa  64.7  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  42.55 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.95 
 
 		 648 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  43.81 
 
 		 681 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  38.05 
 
 		 847 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  47.67 
 
 		 1298 aa  62.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  42.06 
 
 		 3802 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  39.36 
 
 		 1887 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.01 
 
 		 637 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  48.65 
 
 		 617 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  51.85 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  35.51 
 
 		 978 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  42.86 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  41.67 
 
 		 900 aa  60.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  40.78 
 
 		 997 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  26.63 
 
 		 744 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1200 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  39 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.1 
 
 		 1628 aa  58.9  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  34.11 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1213 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.68 
 
 		 998 aa  57.4  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  36.29 
 
 		 1221 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  38.64 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  38.64 
 
 		 483 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  26.95 
 
 		 1172 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  25.34 
 
 		 692 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  42.27 
 
 		 823 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  40.66 
 
 		 1160 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  45.36 
 
 		 924 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  24.82 
 
 		 771 aa  56.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 438 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  40 
 
 		 854 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  23.29 
 
 		 836 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  40.62 
 
 		 674 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  39.64 
 
 		 543 aa  54.7  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  38.89 
 
 		 674 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  25 
 
 		 2286 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.78 
 
 		 795 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  35.71 
 
 		 880 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  38.14 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  32.37 
 
 		 916 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  45 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.14 
 
 		 1401 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  33.93 
 
 		 674 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  39.39 
 
 		 674 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  37.78 
 
 		 598 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  26.57 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  41.41 
 
 		 671 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  40.66 
 
 		 768 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4117  Fibronectin type III domain protein  28.75 
 
 		 297 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.723284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 		 674 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>