37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0810 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  100 
 
 
433 aa  868    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  67.57 
 
 
339 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  44.23 
 
 
793 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  45.45 
 
 
1159 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  45.38 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  46.91 
 
 
364 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  45.35 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  47.77 
 
 
309 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  48.4 
 
 
369 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  48.86 
 
 
318 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  30.08 
 
 
1708 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  32.8 
 
 
1597 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  42.71 
 
 
916 aa  64.3  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.41 
 
 
4357 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  51 
 
 
830 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  51.9 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  23.03 
 
 
3907 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  43.28 
 
 
407 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  45.45 
 
 
1394 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  45.57 
 
 
356 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  36.14 
 
 
682 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0056  dehydrogenase subunit  50.77 
 
 
524 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  39.42 
 
 
671 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.44 
 
 
257 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  50 
 
 
914 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  57.78 
 
 
338 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  51.85 
 
 
1281 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.18 
 
 
2313 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  47.76 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.21 
 
 
1888 aa  45.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.16 
 
 
846 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  43.06 
 
 
625 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  24 
 
 
6678 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2552  hypothetical protein  51.02 
 
 
395 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.920412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.29 
 
 
261 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.02 
 
 
555 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>