140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1203 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 778 aa  1499    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  41.67 
 
 		 1231 aa  151  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1019  hypothetical protein  38.46 
 
 		 218 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.298297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  36.36 
 
 		 996 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  34.5 
 
 		 1042 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  38.55 
 
 		 941 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 638 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3047  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  107  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  35.54 
 
 		 1092 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.25 
 
 		 777 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.93 
 
 		 865 aa  102  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  34.68 
 
 		 867 aa  98.6  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  36.42 
 
 		 616 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  36.23 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.1 
 
 		 602 aa  77.8  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.125341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0904  hypothetical protein  38.1 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  31.65 
 
 		 139 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  54.21 
 
 		 2353 aa  67.8  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  31.17 
 
 		 272 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  38.69 
 
 		 875 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.93 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  32.97 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.37 
 
 		 139 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  49.53 
 
 		 830 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.66 
 
 		 1143 aa  61.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  31.33 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  32.58 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  27.23 
 
 		 222 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48579  predicted protein  27.52 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.000247197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  31.41 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2105  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1050 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  29.29 
 
 		 134 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  31.01 
 
 		 212 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  28.78 
 
 		 596 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  30.08 
 
 		 164 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  57.97 
 
 		 676 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  36.94 
 
 		 214 aa  55.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  31.01 
 
 		 217 aa  55.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  32 
 
 		 141 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  31.13 
 
 		 186 aa  53.9  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1282  hypothetical protein  36.67 
 
 		 79 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.943116  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  29.55 
 
 		 161 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  28.87 
 
 		 142 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  29.05 
 
 		 190 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  29.05 
 
 		 190 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  42.57 
 
 		 1394 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.5 
 
 		 141 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  28.37 
 
 		 140 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  29.77 
 
 		 215 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  29.87 
 
 		 215 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  29.55 
 
 		 167 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  52.46 
 
 		 914 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1886  hypothetical protein  38.1 
 
 		 136 aa  51.6  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2920  hypothetical protein  38.1 
 
 		 136 aa  51.6  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000191516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  31.48 
 
 		 224 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  34.04 
 
 		 168 aa  51.2  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  32.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  32.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  32.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  50 
 
 		 453 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  26.67 
 
 		 202 aa  50.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  25.88 
 
 		 163 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  22.93 
 
 		 279 aa  51.2  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  30.85 
 
 		 201 aa  50.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.03 
 
 		 558 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  25.88 
 
 		 163 aa  50.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  28.39 
 
 		 189 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2188  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1103 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  33.64 
 
 		 235 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  31.02 
 
 		 200 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  27.5 
 
 		 161 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  35.78 
 
 		 134 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 		 227 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  41.49 
 
 		 489 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  31.93 
 
 		 273 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 191 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  26.09 
 
 		 354 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  35.19 
 
 		 220 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0179  hypothetical protein  30.58 
 
 		 544 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  28.17 
 
 		 140 aa  48.5  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  28.24 
 
 		 218 aa  48.5  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 		 169 aa  48.5  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  30.48 
 
 		 200 aa  48.5  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  27.59 
 
 		 165 aa  48.5  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47823  predicted protein  36.76 
 
 		 219 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  32.59 
 
 		 194 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  30.37 
 
 		 233 aa  48.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  30.84 
 
 		 226 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  29.69 
 
 		 133 aa  48.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  31.34 
 
 		 208 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  25.52 
 
 		 187 aa  48.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  28.48 
 
 		 166 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  26.72 
 
 		 231 aa  47.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  31.85 
 
 		 227 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 240 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 240 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 240 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  33.03 
 
 		 134 aa  47  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  26.81 
 
 		 133 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>