34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44995 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  100 
 
 
1217 aa  2497    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  91.61 
 
 
840 aa  930    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8537  predicted protein  96.92 
 
 
65 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400329  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  64.52 
 
 
551 aa  84.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  60.94 
 
 
555 aa  84.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43412  predicted protein  29.6 
 
 
454 aa  73.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  64 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  32.43 
 
 
1727 aa  68.6  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43513  predicted protein  29.8 
 
 
450 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.868692  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  47.89 
 
 
504 aa  65.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  44.59 
 
 
488 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  59.26 
 
 
582 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  34.92 
 
 
617 aa  54.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43495  predicted protein  23.77 
 
 
452 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00000588522  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43460  predicted protein  29.39 
 
 
515 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43410  predicted protein  25.1 
 
 
459 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  36.14 
 
 
521 aa  48.9  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12456  frustulin 5  35.24 
 
 
283 aa  48.5  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240417  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  41.1 
 
 
882 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44203  predicted protein  50 
 
 
658 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  40 
 
 
1245 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  31.75 
 
 
1000 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  30.08 
 
 
755 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  34.18 
 
 
588 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  40 
 
 
1245 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  50 
 
 
1096 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47657  predicted protein  38.27 
 
 
583 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  49.21 
 
 
768 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2617  hypothetical protein  30.37 
 
 
213 aa  46.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0815207  hitchhiker  0.00770419 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43494  predicted protein  24.44 
 
 
456 aa  45.8  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0119061  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  50.75 
 
 
682 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 
261 aa  45.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  33.03 
 
 
1281 aa  45.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  49.23 
 
 
467 aa  45.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>