85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4218 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  772    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  38.8 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  38.8 
 
 		 368 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  40.37 
 
 		 293 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  42.2 
 
 		 256 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  40.91 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  44.74 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  39.19 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  40.85 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.1 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  47.52 
 
 		 926 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  38.75 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  43.42 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  43.42 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  27.18 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  40.28 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  43.55 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  39.06 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  38.46 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  48 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  44.29 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  35.4 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  35.38 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.21 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  23.3 
 
 		 1394 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  36.51 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  37.39 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0650  hypothetical protein  41.46 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.918476  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  32.1 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 279 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 199 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.79 
 
 		 830 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 246 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  41.94 
 
 		 630 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 273 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  33.66 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  40 
 
 		 755 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  28.03 
 
 		 840 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  25.96 
 
 		 245 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  43.28 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  39.05 
 
 		 268 aa  50.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  28.38 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  32.22 
 
 		 314 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 		 266 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  36.36 
 
 		 136 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  35.82 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  29.58 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  44.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  37.14 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12456  frustulin 5  42.86 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 265 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  27.39 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  40.32 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.75 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  24.36 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  32.32 
 
 		 674 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  32.48 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  34.38 
 
 		 163 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  30.56 
 
 		 548 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  35 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  32.81 
 
 		 188 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  32.63 
 
 		 928 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 241 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  40.74 
 
 		 897 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  47.92 
 
 		 501 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  36.26 
 
 		 489 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  31.4 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>