24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30179 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1212    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  47.42 
 
 		 504 aa  87.4  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  32.43 
 
 		 840 aa  76.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  37.3 
 
 		 1000 aa  70.9  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  60.78 
 
 		 521 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30.33 
 
 		 916 aa  60.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  35.4 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  42.86 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  38.89 
 
 		 590 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  28.23 
 
 		 555 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  60.87 
 
 		 128 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  34.92 
 
 		 1217 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.84 
 
 		 1781 aa  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  27.06 
 
 		 551 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01560  tubulin binding protein, putative  41.74 
 
 		 2072 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1526  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.15 
 
 		 411 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597121  normal  0.0174426 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37297  predicted protein  44.3 
 
 		 527 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0209176  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35442  predicted protein  33.09 
 
 		 757 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.725158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1702  articulin, putative  44.44 
 
 		 312 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  34.55 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33729  predicted protein  45.07 
 
 		 679 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.5 
 
 		 2179 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  37.36 
 
 		 1261 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 		 339 aa  43.9  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000498566  decreased coverage  0.0000954183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>