104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1286 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 
2051 aa  4084    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  58.72 
 
 
2011 aa  2105    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  36.69 
 
 
2047 aa  877    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  73.56 
 
 
2056 aa  2885    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  56.23 
 
 
2040 aa  2037    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  38.04 
 
 
2067 aa  1083    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  37.21 
 
 
2084 aa  959    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  33.04 
 
 
2043 aa  747    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  36.13 
 
 
2052 aa  841    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  39.2 
 
 
2039 aa  1108    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  40.19 
 
 
2027 aa  1130    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  30.04 
 
 
2069 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  31.17 
 
 
1994 aa  544  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  35.16 
 
 
1001 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  30.69 
 
 
1052 aa  244  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.61 
 
 
5745 aa  150  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  26.8 
 
 
1367 aa  135  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.47 
 
 
4978 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.27 
 
 
1597 aa  120  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  29.77 
 
 
1268 aa  116  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  26.47 
 
 
1363 aa  112  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.44 
 
 
3191 aa  112  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  25.73 
 
 
721 aa  111  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  29.31 
 
 
1269 aa  105  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  24.94 
 
 
4848 aa  103  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.74 
 
 
1269 aa  99.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.13 
 
 
3474 aa  95.5  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  26.07 
 
 
2816 aa  90.5  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.94 
 
 
3816 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  27.79 
 
 
9585 aa  87  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.25 
 
 
1879 aa  82.4  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.17 
 
 
3911 aa  82  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.84 
 
 
2114 aa  80.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.4 
 
 
2042 aa  80.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.01 
 
 
850 aa  79.7  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  27.66 
 
 
3477 aa  78.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  24.24 
 
 
9867 aa  74.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  27.75 
 
 
3544 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.22 
 
 
994 aa  73.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.46 
 
 
1215 aa  71.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.46 
 
 
1215 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.39 
 
 
1628 aa  70.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.84 
 
 
2192 aa  69.3  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.84 
 
 
2503 aa  69.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.61 
 
 
1884 aa  69.3  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.28 
 
 
3699 aa  69.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.11 
 
 
4122 aa  69.3  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  28.83 
 
 
864 aa  68.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.43 
 
 
761 aa  68.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  29 
 
 
2153 aa  67.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  34.46 
 
 
892 aa  67  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 
1215 aa  66.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 
1215 aa  65.9  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.33 
 
 
1066 aa  65.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 
1215 aa  65.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.56 
 
 
2522 aa  64.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  29.65 
 
 
2476 aa  64.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.81 
 
 
1512 aa  64.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  31.16 
 
 
1712 aa  64.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.99 
 
 
3699 aa  64.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  29.38 
 
 
2670 aa  63.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.43 
 
 
2377 aa  61.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.87 
 
 
2839 aa  60.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  33.16 
 
 
744 aa  60.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.46 
 
 
1848 aa  58.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25.34 
 
 
725 aa  57.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  32.95 
 
 
1911 aa  58.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  26.03 
 
 
16322 aa  57.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  29.64 
 
 
1199 aa  57.4  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  29.22 
 
 
1887 aa  57  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  25.33 
 
 
1502 aa  57.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.06 
 
 
2807 aa  57  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  28.79 
 
 
1416 aa  57  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.28 
 
 
3089 aa  56.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  26.09 
 
 
865 aa  56.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  29.81 
 
 
663 aa  56.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  24.46 
 
 
2767 aa  55.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.88 
 
 
369 aa  54.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  27.1 
 
 
2555 aa  54.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  32.67 
 
 
1067 aa  53.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  26.65 
 
 
814 aa  53.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  29.44 
 
 
722 aa  53.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  33.8 
 
 
743 aa  52.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  24.71 
 
 
1781 aa  52.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.67 
 
 
1706 aa  52.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  28.19 
 
 
1744 aa  51.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  28.22 
 
 
448 aa  51.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  35.16 
 
 
539 aa  51.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  26.29 
 
 
2715 aa  50.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.26 
 
 
3363 aa  50.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  24.22 
 
 
2353 aa  49.7  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  30.99 
 
 
755 aa  49.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  31.29 
 
 
743 aa  49.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  22.94 
 
 
1408 aa  48.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  27.48 
 
 
1422 aa  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  22.94 
 
 
1410 aa  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  22.94 
 
 
1410 aa  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  30.13 
 
 
743 aa  47.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  28.35 
 
 
692 aa  47.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  36.56 
 
 
994 aa  46.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>