34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1793 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  49.41 
 
 		 692 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  50 
 
 		 683 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  46.07 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  52.78 
 
 		 656 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  46.25 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  42.05 
 
 		 1067 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  39.22 
 
 		 2998 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1139 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  38.14 
 
 		 1199 aa  52.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  34.43 
 
 		 1307 aa  51.6  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  39.13 
 
 		 1401 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  37 
 
 		 918 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.64 
 
 		 492 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  37.74 
 
 		 782 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  35.24 
 
 		 1847 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  33 
 
 		 725 aa  45.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  33.33 
 
 		 548 aa  45.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  32.79 
 
 		 972 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  34.48 
 
 		 3802 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1123 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  29.41 
 
 		 409 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  32.81 
 
 		 1628 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  36.36 
 
 		 2047 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  37.23 
 
 		 2927 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  35 
 
 		 1401 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.29 
 
 		 648 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.53 
 
 		 9585 aa  42.4  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  27.18 
 
 		 1172 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  33.33 
 
 		 3027 aa  41.6  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  32.47 
 
 		 1115 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.26 
 
 		 2334 aa  41.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  34.52 
 
 		 1550 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  35.71 
 
 		 1753 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>