16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1004 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  100 
 
 
2998 aa  6069    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 
1372 aa  88.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3662  von Willebrand factor type D protein  27.38 
 
 
2041 aa  85.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  47.78 
 
 
692 aa  75.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.84 
 
 
1154 aa  74.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  42.86 
 
 
277 aa  70.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  45.24 
 
 
278 aa  69.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  46.99 
 
 
656 aa  68.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_003296  RS03920  putative transmembrane protein  27.44 
 
 
652 aa  65.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  46.15 
 
 
683 aa  62.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  49.5 
 
 
460 aa  59.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  39.22 
 
 
224 aa  59.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  39.08 
 
 
1067 aa  58.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  38 
 
 
1199 aa  51.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  36.73 
 
 
782 aa  47.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.69 
 
 
3802 aa  47  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>