205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0496 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  100 
 
 
1550 aa  3128    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  83.07 
 
 
2884 aa  528  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  54.97 
 
 
1452 aa  338  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  33.64 
 
 
600 aa  171  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.72 
 
 
706 aa  170  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.47 
 
 
619 aa  161  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  32.65 
 
 
637 aa  161  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  31.03 
 
 
600 aa  160  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  35.76 
 
 
640 aa  159  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.86 
 
 
769 aa  158  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  40.84 
 
 
688 aa  157  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  35.62 
 
 
570 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.71 
 
 
871 aa  141  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.86 
 
 
326 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
860 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.89 
 
 
795 aa  135  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.77 
 
 
510 aa  133  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  25.42 
 
 
888 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  28.81 
 
 
1916 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.36 
 
 
624 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  34.08 
 
 
1037 aa  125  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.43 
 
 
649 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.49 
 
 
885 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.65 
 
 
538 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  31.33 
 
 
998 aa  120  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.97 
 
 
1312 aa  119  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.64 
 
 
543 aa  118  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.27 
 
 
386 aa  117  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.47 
 
 
1412 aa  117  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.45 
 
 
1073 aa  116  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  32.44 
 
 
678 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  35.71 
 
 
554 aa  113  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  27.59 
 
 
962 aa  113  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.24 
 
 
719 aa  112  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  33.87 
 
 
976 aa  112  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.67 
 
 
530 aa  110  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.27 
 
 
464 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  32.27 
 
 
661 aa  109  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.89 
 
 
600 aa  108  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  28.77 
 
 
589 aa  108  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.09 
 
 
1045 aa  108  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  30.86 
 
 
848 aa  108  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.92 
 
 
749 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.76 
 
 
609 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.03 
 
 
847 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 
448 aa  106  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  30.82 
 
 
635 aa  106  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  39.45 
 
 
1879 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.34 
 
 
905 aa  104  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.61 
 
 
442 aa  103  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.84 
 
 
688 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  43.62 
 
 
2522 aa  100  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  58.24 
 
 
2476 aa  99.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.17 
 
 
475 aa  99.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 
1192 aa  99.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.66 
 
 
551 aa  99  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.22 
 
 
635 aa  99  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  55.43 
 
 
2192 aa  98.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 
2042 aa  98.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.79 
 
 
684 aa  97.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  29.77 
 
 
673 aa  97.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  32.56 
 
 
841 aa  97.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  40.52 
 
 
3544 aa  95.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  28.97 
 
 
643 aa  94.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.43 
 
 
656 aa  94.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  51.09 
 
 
2503 aa  90.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  30.43 
 
 
714 aa  90.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.33 
 
 
1199 aa  90.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.69 
 
 
1362 aa  90.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  46.79 
 
 
1132 aa  90.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.17 
 
 
1507 aa  88.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.66 
 
 
600 aa  87.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.76 
 
 
3699 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  53.93 
 
 
1911 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  53.76 
 
 
3699 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  42.71 
 
 
3563 aa  84.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  51.19 
 
 
14944 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  27.27 
 
 
682 aa  82.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.57 
 
 
1628 aa  82.4  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  34.5 
 
 
1462 aa  82.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  51.85 
 
 
2003 aa  82  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  30.74 
 
 
667 aa  81.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.2 
 
 
833 aa  80.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.17 
 
 
663 aa  80.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  46.36 
 
 
1848 aa  80.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  34.11 
 
 
9585 aa  79.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  38.5 
 
 
1067 aa  79  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.22 
 
 
627 aa  77.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  49.46 
 
 
1969 aa  75.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  30.61 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.18 
 
 
1607 aa  74.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  45.1 
 
 
1657 aa  73.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30 
 
 
1059 aa  73.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  33.75 
 
 
2207 aa  73.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.21 
 
 
725 aa  72.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.84 
 
 
1221 aa  72.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  44.21 
 
 
1976 aa  72  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  40.57 
 
 
972 aa  72  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  50.63 
 
 
441 aa  71.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  36.26 
 
 
428 aa  71.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>