123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4481 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  100 
 
 
637 aa  1285    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  40 
 
 
570 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.8 
 
 
795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  37.78 
 
 
600 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  35.21 
 
 
640 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.31 
 
 
649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.89 
 
 
326 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.71 
 
 
706 aa  167  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.38 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.65 
 
 
1550 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.2 
 
 
2884 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.03 
 
 
860 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.88 
 
 
871 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.64 
 
 
769 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.01 
 
 
847 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  30.79 
 
 
600 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  34.72 
 
 
688 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.52 
 
 
543 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  30.23 
 
 
1452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  33.57 
 
 
1037 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 
749 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.56 
 
 
885 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.33 
 
 
530 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.45 
 
 
1073 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.21 
 
 
619 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  30.84 
 
 
1916 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  33.96 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28 
 
 
1045 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  33.88 
 
 
998 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  29.28 
 
 
962 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.69 
 
 
1412 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  28.99 
 
 
1312 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.08 
 
 
905 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.31 
 
 
600 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.65 
 
 
719 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.77 
 
 
442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.02 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.49 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  30.82 
 
 
678 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  33.33 
 
 
976 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.15 
 
 
1192 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.51 
 
 
342 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.03 
 
 
464 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.6 
 
 
510 aa  104  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  29.65 
 
 
848 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.15 
 
 
624 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  28.79 
 
 
589 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  30.97 
 
 
682 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  33.55 
 
 
643 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  33 
 
 
841 aa  95.1  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  29.57 
 
 
661 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  30.13 
 
 
1756 aa  93.6  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  31.8 
 
 
635 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.07 
 
 
635 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  32.92 
 
 
667 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.83 
 
 
297 aa  89.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.22 
 
 
688 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.58 
 
 
684 aa  87  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  28.57 
 
 
673 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.29 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.39 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.62 
 
 
833 aa  84.7  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.55 
 
 
656 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.78 
 
 
600 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.08 
 
 
663 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.5 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  35.9 
 
 
766 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.25 
 
 
627 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.65 
 
 
1351 aa  72  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  33.91 
 
 
760 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  33.91 
 
 
760 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  31.44 
 
 
714 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.15 
 
 
1135 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  34.78 
 
 
766 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  35.92 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  35.92 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  33.55 
 
 
993 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  33.91 
 
 
765 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.41 
 
 
1112 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  33.91 
 
 
779 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.41 
 
 
1070 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.41 
 
 
1070 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  33.91 
 
 
542 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  33.91 
 
 
755 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  33.91 
 
 
772 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  32.74 
 
 
1011 aa  67  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  32.37 
 
 
994 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  32.88 
 
 
370 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  30.21 
 
 
1012 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.65 
 
 
1059 aa  64.3  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  29.11 
 
 
643 aa  63.9  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  27.84 
 
 
587 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  34 
 
 
1052 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  36.19 
 
 
1266 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.83 
 
 
347 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  29.13 
 
 
1088 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  30.28 
 
 
1231 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  30.7 
 
 
330 aa  57.8  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  30.83 
 
 
205 aa  57.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  30.6 
 
 
772 aa  57.4  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>