72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0390 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  100 
 
 		 442 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  50 
 
 		 1192 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  51.88 
 
 		 847 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  47.92 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  50.74 
 
 		 684 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  46.73 
 
 		 848 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  50 
 
 		 905 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  48.29 
 
 		 682 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  48.19 
 
 		 1412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  45.68 
 
 		 600 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  44.71 
 
 		 885 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  46.96 
 
 		 643 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  46.88 
 
 		 871 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  44.72 
 
 		 976 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  45.15 
 
 		 554 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  41.79 
 
 		 589 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  45.05 
 
 		 998 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.95 
 
 		 656 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  41.96 
 
 		 1037 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  38.51 
 
 		 635 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  43.38 
 
 		 673 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  40.3 
 
 		 609 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  42.41 
 
 		 661 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.6 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.7 
 
 		 624 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  42.02 
 
 		 1073 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  39.3 
 
 		 627 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  39.44 
 
 		 714 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  41.03 
 
 		 678 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.53 
 
 		 688 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.78 
 
 		 640 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  37.85 
 
 		 688 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.49 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  31.73 
 
 		 600 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  44.21 
 
 		 635 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.77 
 
 		 769 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.37 
 
 		 326 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.53 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.78 
 
 		 706 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.45 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.5 
 
 		 386 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  34.23 
 
 		 1312 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  40.55 
 
 		 667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  35.77 
 
 		 637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.01 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.52 
 
 		 795 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.22 
 
 		 619 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.77 
 
 		 860 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.59 
 
 		 719 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.42 
 
 		 2884 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.61 
 
 		 1550 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.99 
 
 		 530 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.59 
 
 		 1045 aa  99.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.63 
 
 		 600 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  29.73 
 
 		 1452 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  36.52 
 
 		 841 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.77 
 
 		 962 aa  90.9  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.91 
 
 		 649 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  27.27 
 
 		 600 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0382  hypothetical protein  54.32 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  33.01 
 
 		 1916 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  23.89 
 
 		 538 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.28 
 
 		 749 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.05 
 
 		 833 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.15 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0971  hypothetical protein  35.9 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0596045  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  37.89 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.56 
 
 		 475 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1081  hypothetical protein  34.15 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.590412  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.49 
 
 		 1059 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  31.98 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.49 
 
 		 1135 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>