82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0161 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 342 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.57 
 
 		 1059 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  31.38 
 
 		 600 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.32 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.14 
 
 		 570 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  35.53 
 
 		 962 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.99 
 
 		 640 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.84 
 
 		 1045 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  31.37 
 
 		 637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.65 
 
 		 1312 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.87 
 
 		 649 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.22 
 
 		 510 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.42 
 
 		 833 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.58 
 
 		 1073 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  31.07 
 
 		 688 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.8 
 
 		 769 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.08 
 
 		 795 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.91 
 
 		 543 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.49 
 
 		 706 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.62 
 
 		 530 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  31.06 
 
 		 1037 aa  86.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.83 
 
 		 600 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.88 
 
 		 871 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30 
 
 		 885 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  37.57 
 
 		 841 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.24 
 
 		 749 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  31.92 
 
 		 1916 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  36.02 
 
 		 848 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  29.97 
 
 		 976 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  35.53 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.26 
 
 		 905 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.02 
 
 		 847 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  28.27 
 
 		 600 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  27.73 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.07 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  28.44 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  29.58 
 
 		 1452 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.73 
 
 		 624 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.91 
 
 		 619 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.37 
 
 		 448 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.43 
 
 		 719 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  30.12 
 
 		 714 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  29.7 
 
 		 998 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.16 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.51 
 
 		 860 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  28.44 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  36.52 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.05 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.94 
 
 		 1412 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.51 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  29.7 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  35.4 
 
 		 661 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.11 
 
 		 2884 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  33.2 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.19 
 
 		 1550 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  36.77 
 
 		 1192 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  33.13 
 
 		 682 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.32 
 
 		 688 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  31.47 
 
 		 673 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.76 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.67 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.16 
 
 		 684 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.65 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.57 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.51 
 
 		 1135 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  34.72 
 
 		 667 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  34.55 
 
 		 589 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  39.02 
 
 		 635 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.94 
 
 		 627 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0566  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0709  putative lipoprotein  23 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411916 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0186  transcriptional regulator, ArsR family protein  25 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0276  transcriptional regulator, ArsR family protein  25 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0563  hypothetical protein  23.28 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0564  hypothetical protein  23.28 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0548  hypothetical protein  24.3 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0688  putative lipoprotein  23.77 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0668852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4650  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00382445  unclonable  9.97545e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0781  putative lipoprotein  24 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0620  hypothetical protein  24.21 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0720  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>