71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  100 
 
 		 297 aa  567  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.04 
 
 		 706 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  44.61 
 
 		 600 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  34.47 
 
 		 962 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.87 
 
 		 769 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.02 
 
 		 1045 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  33.21 
 
 		 600 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  36.77 
 
 		 637 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  35 
 
 		 1312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.46 
 
 		 871 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.97 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  33.98 
 
 		 688 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.85 
 
 		 1550 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.46 
 
 		 649 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.48 
 
 		 543 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.6 
 
 		 570 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.82 
 
 		 795 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.73 
 
 		 860 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.84 
 
 		 2884 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  39.41 
 
 		 1073 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 640 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.2 
 
 		 619 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.63 
 
 		 475 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  37.38 
 
 		 998 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.22 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  38.72 
 
 		 554 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  31.25 
 
 		 1452 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  29.33 
 
 		 600 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  29.32 
 
 		 538 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  34.77 
 
 		 976 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.31 
 
 		 719 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35 
 
 		 885 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  32.18 
 
 		 848 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.46 
 
 		 551 aa  95.5  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  31.97 
 
 		 635 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.49 
 
 		 624 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  30.63 
 
 		 589 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  35.86 
 
 		 841 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.86 
 
 		 386 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.3 
 
 		 530 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  33.77 
 
 		 678 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.08 
 
 		 847 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.2 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  31.31 
 
 		 688 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.74 
 
 		 1059 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.13 
 
 		 600 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  36.26 
 
 		 661 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  32.21 
 
 		 673 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  33.84 
 
 		 627 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.9 
 
 		 749 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  34.36 
 
 		 1037 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  32.21 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  32.08 
 
 		 1916 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.8 
 
 		 905 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.09 
 
 		 833 aa  82.8  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.81 
 
 		 1412 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.41 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  32.65 
 
 		 682 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  31.77 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  35.52 
 
 		 635 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.59 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.25 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.1 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.57 
 
 		 656 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  31.63 
 
 		 643 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.91 
 
 		 1192 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  34.13 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  34.88 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.25 
 
 		 684 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.84 
 
 		 1135 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>