282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5764 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 		 635 aa  1229    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  49.68 
 
 		 667 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.06 
 
 		 624 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  38.94 
 
 		 678 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  35.41 
 
 		 688 aa  270  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  37.2 
 
 		 661 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  35.57 
 
 		 635 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  37.11 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.73 
 
 		 656 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  35.13 
 
 		 673 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  42.05 
 
 		 609 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  43.92 
 
 		 386 aa  187  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  47.35 
 
 		 1073 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  42.72 
 
 		 1037 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.74 
 
 		 663 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  42.04 
 
 		 627 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.25 
 
 		 871 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  44.91 
 
 		 442 aa  156  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.2 
 
 		 847 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  40.48 
 
 		 976 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.36 
 
 		 684 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.08 
 
 		 1412 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  38.96 
 
 		 998 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  39.87 
 
 		 643 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.48 
 
 		 719 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.18 
 
 		 905 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.21 
 
 		 706 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  41.2 
 
 		 682 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  41.43 
 
 		 554 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.83 
 
 		 464 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  32.8 
 
 		 538 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  34.73 
 
 		 848 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  41.55 
 
 		 841 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  36.89 
 
 		 1192 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.5 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  35.81 
 
 		 589 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.31 
 
 		 885 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.22 
 
 		 1550 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.77 
 
 		 2884 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.77 
 
 		 860 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  36.54 
 
 		 688 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.22 
 
 		 769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  29.84 
 
 		 640 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  31.19 
 
 		 637 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.9 
 
 		 600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.06 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.55 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  29.57 
 
 		 1452 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  27.72 
 
 		 570 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  29.23 
 
 		 600 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.82 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  30.77 
 
 		 1312 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 543 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.68 
 
 		 326 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.57 
 
 		 600 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.84 
 
 		 1045 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.64 
 
 		 649 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  29.19 
 
 		 962 aa  84.3  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.62 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.26 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.64 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  31.58 
 
 		 1916 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.07 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.9 
 
 		 749 aa  71.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  33.5 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.29 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.51 
 
 		 434 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.61 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.24 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.15 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.15 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  32.91 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.02 
 
 		 1059 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.15 
 
 		 434 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.58 
 
 		 435 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.98 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  30.43 
 
 		 354 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.36 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.69 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.83 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  29.18 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  23.68 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  25.29 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.02 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  31.52 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  31.89 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  32.32 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.52 
 
 		 434 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  35.29 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27.98 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  27.46 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  29.94 
 
 		 1005 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  28.11 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  26.94 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  25.09 
 
 		 454 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>