70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0507 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 		 600 aa  1189    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  37.38 
 
 		 848 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  45.68 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.41 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.78 
 
 		 847 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  39.49 
 
 		 682 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  38.23 
 
 		 1192 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  33.41 
 
 		 589 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.86 
 
 		 885 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  37.68 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.9 
 
 		 684 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.17 
 
 		 871 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  37.7 
 
 		 643 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.19 
 
 		 1412 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.55 
 
 		 905 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.97 
 
 		 448 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  37.1 
 
 		 976 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  35.75 
 
 		 1037 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  34.29 
 
 		 714 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  36.74 
 
 		 1073 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  47.13 
 
 		 998 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  34.42 
 
 		 627 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.21 
 
 		 656 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  34.76 
 
 		 673 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.79 
 
 		 688 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  33.43 
 
 		 661 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  34.06 
 
 		 678 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.04 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  33.06 
 
 		 635 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.67 
 
 		 624 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  27.56 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  33.84 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.02 
 
 		 326 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  44.74 
 
 		 688 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  28.27 
 
 		 1312 aa  96.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.94 
 
 		 706 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.71 
 
 		 510 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  27.3 
 
 		 570 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  37.25 
 
 		 841 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.3 
 
 		 1045 aa  92.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  27.02 
 
 		 600 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.23 
 
 		 663 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  29.11 
 
 		 962 aa  89  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.66 
 
 		 1550 aa  87.4  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  28.25 
 
 		 1452 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.25 
 
 		 635 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.14 
 
 		 2884 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.53 
 
 		 860 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.27 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.12 
 
 		 795 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  26.78 
 
 		 637 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.24 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.96 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.38 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  26.32 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.88 
 
 		 600 aa  70.5  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.87 
 
 		 769 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.16 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.71 
 
 		 833 aa  66.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.73 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  26.02 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.94 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  29.1 
 
 		 667 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  34.38 
 
 		 1916 aa  57  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.54 
 
 		 551 aa  54.3  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1209 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.51 
 
 		 749 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.65 
 
 		 1059 aa  51.2  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  31.27 
 
 		 297 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  36.25 
 
 		 840 aa  44.3  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>