72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3709 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  100 
 
 		 643 aa  1258    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  42.26 
 
 		 682 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  38.27 
 
 		 848 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.9 
 
 		 871 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  46.96 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.45 
 
 		 684 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  39.44 
 
 		 589 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  39 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.5 
 
 		 885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  45.48 
 
 		 976 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.33 
 
 		 905 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.57 
 
 		 464 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.73 
 
 		 847 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.92 
 
 		 1412 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  41.34 
 
 		 998 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.7 
 
 		 600 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  42.02 
 
 		 1192 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  41.72 
 
 		 1037 aa  161  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.37 
 
 		 624 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  41.16 
 
 		 635 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  42.51 
 
 		 1073 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  40.69 
 
 		 673 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.28 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  38.53 
 
 		 661 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  39.81 
 
 		 678 aa  140  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.15 
 
 		 688 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.46 
 
 		 386 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  37.6 
 
 		 609 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.5 
 
 		 719 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  36.45 
 
 		 714 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.47 
 
 		 706 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.46 
 
 		 627 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  37.6 
 
 		 635 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.67 
 
 		 510 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  35.24 
 
 		 667 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.43 
 
 		 656 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.89 
 
 		 663 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.62 
 
 		 1045 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.25 
 
 		 326 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  30.56 
 
 		 640 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  33.65 
 
 		 637 aa  97.4  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  34.7 
 
 		 688 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  28.45 
 
 		 570 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.97 
 
 		 1550 aa  95.1  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.71 
 
 		 543 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  35.49 
 
 		 841 aa  91.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.47 
 
 		 769 aa  91.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  28.86 
 
 		 1312 aa  91.3  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.43 
 
 		 860 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.49 
 
 		 600 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.19 
 
 		 2884 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  31.36 
 
 		 538 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.39 
 
 		 962 aa  86.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.86 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.72 
 
 		 833 aa  78.2  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.3 
 
 		 649 aa  75.5  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  28.53 
 
 		 1452 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.08 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.39 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  26.64 
 
 		 600 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.52 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.35 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.69 
 
 		 749 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.95 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  29.49 
 
 		 1916 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  32.47 
 
 		 370 aa  48.9  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1682 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.39 
 
 		 551 aa  45.8  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  23.89 
 
 		 1463 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.08 
 
 		 735 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  29.07 
 
 		 1387 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25 
 
 		 1862 aa  44.3  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>