61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4483 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
1135 aa  2238    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.2 
 
 
749 aa  162  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.24 
 
 
795 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  32 
 
 
600 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  32.05 
 
 
570 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.57 
 
 
326 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  29.34 
 
 
538 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  30.79 
 
 
640 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  29.79 
 
 
688 aa  107  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.78 
 
 
962 aa  104  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.1 
 
 
860 aa  103  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.52 
 
 
649 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.38 
 
 
706 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.04 
 
 
1045 aa  97.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.43 
 
 
769 aa  96.3  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  27.11 
 
 
637 aa  92.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  31.54 
 
 
976 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  28.25 
 
 
1312 aa  89  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.05 
 
 
543 aa  85.5  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.93 
 
 
871 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.89 
 
 
619 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  29.25 
 
 
1916 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.68 
 
 
510 aa  81.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.43 
 
 
530 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.68 
 
 
905 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.12 
 
 
847 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  29.9 
 
 
1452 aa  76.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  29.53 
 
 
998 aa  75.1  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  29.29 
 
 
1550 aa  74.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.25 
 
 
1192 aa  73.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.68 
 
 
342 aa  70.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.39 
 
 
386 aa  70.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.24 
 
 
1412 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  28.93 
 
 
589 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.9 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  31.21 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.88 
 
 
2884 aa  67.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.49 
 
 
442 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  27.99 
 
 
600 aa  66.6  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.67 
 
 
1073 aa  66.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  29.1 
 
 
682 aa  65.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.94 
 
 
1059 aa  63.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.14 
 
 
885 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  28.14 
 
 
848 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  27.72 
 
 
1037 aa  62.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  31.47 
 
 
370 aa  62  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.99 
 
 
624 aa  61.6  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.54 
 
 
475 aa  57.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  31.62 
 
 
673 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.36 
 
 
684 aa  56.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.52 
 
 
448 aa  55.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  29.02 
 
 
643 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  27.27 
 
 
661 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  26.42 
 
 
635 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  26.04 
 
 
688 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  27 
 
 
609 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  29.63 
 
 
678 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.95 
 
 
841 aa  47.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  25.95 
 
 
627 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.96 
 
 
600 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>