200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4482 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
795 aa  1573    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.03 
 
 
649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  42.76 
 
 
600 aa  241  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  40.33 
 
 
640 aa  240  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  41.88 
 
 
570 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  233  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  36.8 
 
 
637 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.47 
 
 
706 aa  201  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.07 
 
 
749 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.23 
 
 
769 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  33.65 
 
 
962 aa  152  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.76 
 
 
1045 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.72 
 
 
619 aa  147  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  32.79 
 
 
1452 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  35.25 
 
 
688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  33.68 
 
 
1916 aa  141  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.45 
 
 
885 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.69 
 
 
847 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.89 
 
 
1550 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  31.23 
 
 
538 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  34.86 
 
 
600 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.74 
 
 
543 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.32 
 
 
871 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  35.89 
 
 
782 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.11 
 
 
2884 aa  129  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  32.65 
 
 
1312 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.02 
 
 
860 aa  127  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.24 
 
 
1412 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  35.58 
 
 
692 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.77 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  32.48 
 
 
998 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.71 
 
 
1192 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  34.26 
 
 
683 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.07 
 
 
905 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  26.52 
 
 
442 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  29.77 
 
 
1037 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.24 
 
 
1135 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.35 
 
 
510 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.71 
 
 
833 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.09 
 
 
448 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.45 
 
 
464 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  30.52 
 
 
554 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  30.5 
 
 
976 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.44 
 
 
684 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.88 
 
 
688 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  29.2 
 
 
848 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.25 
 
 
480 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  32.6 
 
 
1795 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.85 
 
 
1073 aa  95.1  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  29.06 
 
 
589 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.53 
 
 
342 aa  94  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  34.57 
 
 
656 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.79 
 
 
475 aa  93.6  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  28.95 
 
 
661 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  29.18 
 
 
682 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.06 
 
 
600 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  32.42 
 
 
1172 aa  92  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.6 
 
 
624 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  31.32 
 
 
635 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  28.68 
 
 
779 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  28.17 
 
 
673 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.15 
 
 
1059 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  28.88 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.12 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  27.84 
 
 
678 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  39.39 
 
 
551 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  30.73 
 
 
370 aa  79  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  28.97 
 
 
841 aa  78.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  26.43 
 
 
741 aa  79  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.8 
 
 
6885 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  31.75 
 
 
2068 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.73 
 
 
386 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  36.36 
 
 
1067 aa  76.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  29.82 
 
 
1363 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  26.79 
 
 
627 aa  74.7  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.06 
 
 
3507 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.18 
 
 
609 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  29.09 
 
 
9585 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  31.82 
 
 
297 aa  73.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  33.98 
 
 
211 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  28.73 
 
 
1363 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  25.53 
 
 
714 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  29.09 
 
 
1380 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  29.79 
 
 
918 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.46 
 
 
719 aa  70.1  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  25.53 
 
 
643 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  26.14 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  37.04 
 
 
1199 aa  68.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.23 
 
 
648 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  44.09 
 
 
409 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  25.32 
 
 
409 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  26.93 
 
 
1633 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.26 
 
 
1160 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  30.57 
 
 
836 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  24.67 
 
 
428 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  27.69 
 
 
1065 aa  64.7  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  30.81 
 
 
3802 aa  64.3  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  29.96 
 
 
445 aa  64.3  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  32.76 
 
 
743 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>