40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5269 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1633 aa  3105    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  24.38 
 
 		 1795 aa  108  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  27.07 
 
 		 9585 aa  107  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  35.79 
 
 		 692 aa  103  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.32 
 
 		 795 aa  92.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.27 
 
 		 2068 aa  85.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 3333 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  32.66 
 
 		 683 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  30.93 
 
 		 782 aa  77.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  22.36 
 
 		 1042 aa  69.7  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 680 aa  69.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  30.93 
 
 		 1887 aa  67.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  33.73 
 
 		 744 aa  65.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  27.2 
 
 		 1221 aa  65.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  31.67 
 
 		 801 aa  63.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  27.69 
 
 		 480 aa  63.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  31.14 
 
 		 1067 aa  63.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  30.11 
 
 		 1247 aa  60.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1839  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.69 
 
 		 571 aa  58.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  27.4 
 
 		 1172 aa  58.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.6 
 
 		 649 aa  55.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.88 
 
 		 1726 aa  55.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4291  Fibronectin type III domain protein  26.85 
 
 		 2603 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  30.71 
 
 		 448 aa  54.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4301  Fibronectin type III domain protein  26.09 
 
 		 1799 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130951  decreased coverage  0.00087761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  35.07 
 
 		 656 aa  53.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  32.73 
 
 		 1248 aa  53.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  37.37 
 
 		 580 aa  51.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  31.74 
 
 		 768 aa  52  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  22.2 
 
 		 779 aa  51.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  25.09 
 
 		 2334 aa  50.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  27.92 
 
 		 2286 aa  47.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.19 
 
 		 1797 aa  47.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.38 
 
 		 3507 aa  47.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1148  Fibronectin type III domain protein  29.09 
 
 		 955 aa  47.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.950672  decreased coverage  0.0000360258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25.3 
 
 		 725 aa  47  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  32.61 
 
 		 995 aa  47  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  28.12 
 
 		 1050 aa  46.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.21 
 
 		 6885 aa  46.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>