79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1100 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  53.64 
 
 		 1266 aa  647    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  63.67 
 
 		 618 aa  767    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  49.05 
 
 		 1880 aa  851    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  56.4 
 
 		 787 aa  700    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  56.09 
 
 		 773 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1065 aa  2180    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  53.72 
 
 		 613 aa  654    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  57.19 
 
 		 820 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  53.19 
 
 		 662 aa  659    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  58.01 
 
 		 677 aa  720    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  57.59 
 
 		 914 aa  708    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.99 
 
 		 833 aa  702    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  58.63 
 
 		 672 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  55.52 
 
 		 746 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  56.16 
 
 		 743 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  59.13 
 
 		 676 aa  741    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  54.3 
 
 		 744 aa  635  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  51.62 
 
 		 658 aa  606  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  51.59 
 
 		 774 aa  552  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  58.33 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  45.91 
 
 		 616 aa  516  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  37.31 
 
 		 848 aa  360  9e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  40.97 
 
 		 851 aa  349  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  41.14 
 
 		 767 aa  345  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  46.34 
 
 		 1082 aa  343  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  42.75 
 
 		 803 aa  307  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  49.41 
 
 		 240 aa  233  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  30.08 
 
 		 606 aa  218  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  24.73 
 
 		 3802 aa  77  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.05 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.69 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  26.1 
 
 		 667 aa  63.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  27.55 
 
 		 1172 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.36 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.46 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.46 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  36.46 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  36.46 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  44.44 
 
 		 1847 aa  57.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  36.46 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.46 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.46 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  26.56 
 
 		 455 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  25.52 
 
 		 455 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  25.52 
 
 		 455 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 464 aa  55.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  25.13 
 
 		 455 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.33 
 
 		 782 aa  55.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  28.57 
 
 		 1160 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.64 
 
 		 2068 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  29.36 
 
 		 725 aa  55.1  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.8 
 
 		 492 aa  55.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  25.7 
 
 		 458 aa  55.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 455 aa  54.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  32.74 
 
 		 683 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  25.99 
 
 		 455 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  22.52 
 
 		 2170 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  25.99 
 
 		 455 aa  53.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  25.99 
 
 		 455 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  26.54 
 
 		 455 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  25.93 
 
 		 455 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  30.38 
 
 		 3333 aa  51.6  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  23.9 
 
 		 410 aa  51.6  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.46 
 
 		 6885 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  24.21 
 
 		 410 aa  48.5  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  25 
 
 		 455 aa  48.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.03 
 
 		 831 aa  48.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  40.51 
 
 		 2239 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  25.79 
 
 		 404 aa  47.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1230 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.7 
 
 		 1401 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2241  hypothetical protein  24.89 
 
 		 695 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  25.31 
 
 		 458 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  25.56 
 
 		 445 aa  46.2  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  35.37 
 
 		 1753 aa  45.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  29.14 
 
 		 744 aa  45.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.03 
 
 		 506 aa  44.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  25.79 
 
 		 456 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>