233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0923 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  63.69 
 
 		 669 aa  803    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  62.15 
 
 		 743 aa  879    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  100 
 
 		 746 aa  1487    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  55.21 
 
 		 1065 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  60.1 
 
 		 820 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  56.61 
 
 		 773 aa  865    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  55.11 
 
 		 676 aa  661    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  63.18 
 
 		 744 aa  881    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  63.23 
 
 		 774 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  53.73 
 
 		 914 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  54.61 
 
 		 833 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  52.27 
 
 		 1266 aa  608  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  52.59 
 
 		 787 aa  608  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  52.5 
 
 		 658 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  51.42 
 
 		 618 aa  594  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  52.48 
 
 		 662 aa  595  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  50.41 
 
 		 672 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  52.74 
 
 		 1880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  50.98 
 
 		 613 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  49.44 
 
 		 677 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  49.75 
 
 		 616 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  38.5 
 
 		 848 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  67.61 
 
 		 240 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  41.5 
 
 		 767 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  43.07 
 
 		 1082 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  37.22 
 
 		 851 aa  279  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  40 
 
 		 803 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  32.21 
 
 		 606 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  54.35 
 
 		 605 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.7 
 
 		 588 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.9 
 
 		 590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.04 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  53.85 
 
 		 681 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  49.53 
 
 		 1055 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  52.43 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.63 
 
 		 491 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  53.7 
 
 		 459 aa  112  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.51 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 854 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  50.91 
 
 		 934 aa  110  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.34 
 
 		 984 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.83 
 
 		 499 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  45.08 
 
 		 785 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  46.22 
 
 		 767 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.31 
 
 		 979 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  42.14 
 
 		 966 aa  105  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  51.92 
 
 		 489 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  45.95 
 
 		 488 aa  104  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  53.47 
 
 		 906 aa  104  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  50.52 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  42.99 
 
 		 633 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  51.92 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  44.96 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  48.11 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  45.79 
 
 		 974 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  43.7 
 
 		 446 aa  102  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 846 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.69 
 
 		 1128 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 963 aa  101  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.75 
 
 		 628 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  39.33 
 
 		 842 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  41.35 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  44.95 
 
 		 423 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  46.23 
 
 		 990 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  47.27 
 
 		 589 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  47.66 
 
 		 942 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  45.69 
 
 		 794 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  44.44 
 
 		 875 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.14 
 
 		 623 aa  98.2  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  47.12 
 
 		 690 aa  97.8  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 		 812 aa  97.4  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.14 
 
 		 842 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.71 
 
 		 913 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  46.6 
 
 		 854 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  47.52 
 
 		 429 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 438 aa  95.5  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  45.19 
 
 		 925 aa  94.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.83 
 
 		 437 aa  94.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  39.32 
 
 		 525 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  40.87 
 
 		 620 aa  92  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  42.06 
 
 		 533 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  46.15 
 
 		 436 aa  91.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  42.45 
 
 		 580 aa  91.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 894 aa  90.1  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.69 
 
 		 646 aa  90.1  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  43.14 
 
 		 518 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.84 
 
 		 366 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.51 
 
 		 487 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 688 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  42.4 
 
 		 619 aa  89.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  43.81 
 
 		 775 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  49.5 
 
 		 393 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  47 
 
 		 597 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  41.35 
 
 		 364 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  41.35 
 
 		 436 aa  89.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  49.43 
 
 		 460 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  44.23 
 
 		 851 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  41.48 
 
 		 791 aa  88.2  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  44.12 
 
 		 432 aa  88.2  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  43.56 
 
 		 442 aa  87.4  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>