29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3493 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 767 aa  1528    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  64.09 
 
 		 1082 aa  921    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  62.34 
 
 		 851 aa  955    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  54.47 
 
 		 803 aa  796    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  41.14 
 
 		 1065 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  48.67 
 
 		 1880 aa  334  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  39.64 
 
 		 618 aa  320  7e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  43.89 
 
 		 820 aa  317  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  44.23 
 
 		 787 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  45.63 
 
 		 672 aa  310  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  34.37 
 
 		 677 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.05 
 
 		 833 aa  300  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  42.37 
 
 		 914 aa  296  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 773 aa  296  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  36.04 
 
 		 676 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  42.68 
 
 		 662 aa  293  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.5 
 
 		 746 aa  291  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  42.11 
 
 		 743 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  41.4 
 
 		 613 aa  279  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  40.4 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  43 
 
 		 744 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  38.42 
 
 		 1266 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  44.11 
 
 		 774 aa  264  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  40.05 
 
 		 658 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  51.5 
 
 		 669 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  32.76 
 
 		 848 aa  187  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  39.76 
 
 		 240 aa  163  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  28.5 
 
 		 606 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  25.79 
 
 		 667 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>