28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2008 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  71.97 
 
 		 744 aa  362  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  71.01 
 
 		 773 aa  359  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  73.64 
 
 		 743 aa  353  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  68.62 
 
 		 774 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  67.61 
 
 		 746 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 669 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  57.98 
 
 		 820 aa  268  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  54.36 
 
 		 676 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  51.25 
 
 		 616 aa  245  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  53.44 
 
 		 914 aa  235  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.07 
 
 		 833 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  49.41 
 
 		 1065 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  49.41 
 
 		 618 aa  226  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  48.63 
 
 		 662 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  45.04 
 
 		 672 aa  218  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  47.08 
 
 		 658 aa  218  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  45.8 
 
 		 677 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  50.19 
 
 		 613 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  45.49 
 
 		 787 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  45.8 
 
 		 1880 aa  214  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  47.41 
 
 		 1266 aa  209  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  37.97 
 
 		 1082 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  40.64 
 
 		 851 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  39.76 
 
 		 767 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  38.02 
 
 		 803 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  37.45 
 
 		 848 aa  141  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  31.17 
 
 		 606 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>