253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3462 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  56.09 
 
 		 1065 aa  662    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  60.58 
 
 		 669 aa  776    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  62.92 
 
 		 744 aa  945    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  58.84 
 
 		 914 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  55.56 
 
 		 787 aa  678    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  55.16 
 
 		 1266 aa  668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  52.19 
 
 		 677 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  54.52 
 
 		 1880 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  67.11 
 
 		 743 aa  999    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  57.04 
 
 		 820 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  56.18 
 
 		 746 aa  822    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  54.29 
 
 		 618 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  57.71 
 
 		 774 aa  832    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 773 aa  1559    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  52.41 
 
 		 672 aa  653    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  62.63 
 
 		 676 aa  756    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.73 
 
 		 833 aa  691    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  49.58 
 
 		 662 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  49.67 
 
 		 616 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  47.27 
 
 		 658 aa  555  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  47.65 
 
 		 613 aa  551  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  40.1 
 
 		 848 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  71.01 
 
 		 240 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  36.45 
 
 		 1082 aa  296  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  37.5 
 
 		 767 aa  296  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  35.58 
 
 		 851 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  39.85 
 
 		 803 aa  277  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  31.03 
 
 		 606 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  70.98 
 
 		 486 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  48 
 
 		 455 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.28 
 
 		 854 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 		 633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  55.91 
 
 		 456 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  52.34 
 
 		 488 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  56.52 
 
 		 422 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  54.46 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  55.24 
 
 		 459 aa  112  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  49.57 
 
 		 609 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.34 
 
 		 984 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  56.44 
 
 		 518 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.58 
 
 		 767 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 		 1128 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  55.45 
 
 		 688 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  46.9 
 
 		 605 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.85 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  54.17 
 
 		 474 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.45 
 
 		 842 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 812 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  53.61 
 
 		 485 aa  104  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  46.08 
 
 		 925 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 913 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  49.5 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  49.51 
 
 		 596 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.7 
 
 		 846 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  47.12 
 
 		 847 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.31 
 
 		 979 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  53.47 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  49.5 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  43.09 
 
 		 942 aa  101  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  50.52 
 
 		 1055 aa  100  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  47.17 
 
 		 681 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  47.52 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.51 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.48 
 
 		 590 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  41.82 
 
 		 438 aa  97.8  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.57 
 
 		 588 aa  97.8  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  46.08 
 
 		 794 aa  98.2  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 906 aa  97.8  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  43.69 
 
 		 851 aa  97.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.96 
 
 		 448 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  46.09 
 
 		 727 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  45.54 
 
 		 429 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  41.51 
 
 		 864 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  47.62 
 
 		 934 aa  95.9  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  46.73 
 
 		 446 aa  95.5  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  46.67 
 
 		 442 aa  94.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  42.15 
 
 		 974 aa  94.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  43.48 
 
 		 785 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  45.1 
 
 		 487 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  44.12 
 
 		 489 aa  93.2  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  44.79 
 
 		 347 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.28 
 
 		 469 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  43.14 
 
 		 423 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 376 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  45 
 
 		 437 aa  91.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  45.1 
 
 		 488 aa  91.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.81 
 
 		 623 aa  91.3  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  43.14 
 
 		 491 aa  90.1  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  48.78 
 
 		 372 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.93 
 
 		 499 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.46 
 
 		 491 aa  90.1  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.81 
 
 		 842 aa  89.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  45 
 
 		 1007 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 935 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  44.86 
 
 		 966 aa  89.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  41.88 
 
 		 963 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  42.45 
 
 		 775 aa  89.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  41.07 
 
 		 694 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  42.16 
 
 		 364 aa  87.8  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>