164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0246 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  56.88 
 
 		 914 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  56.59 
 
 		 1266 aa  687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  56.88 
 
 		 677 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  54.83 
 
 		 1880 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 820 aa  1680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  59.05 
 
 		 743 aa  756    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  56.45 
 
 		 787 aa  683    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  65.82 
 
 		 676 aa  801    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  60.1 
 
 		 746 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  63.13 
 
 		 744 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  56.53 
 
 		 1065 aa  673    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  67.25 
 
 		 833 aa  781    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  58.26 
 
 		 618 aa  696    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  57.91 
 
 		 773 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  57.99 
 
 		 774 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  54.74 
 
 		 672 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  54.36 
 
 		 616 aa  628  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  52.52 
 
 		 662 aa  616  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  62.66 
 
 		 669 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  53.03 
 
 		 658 aa  606  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  51.32 
 
 		 613 aa  599  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  42.79 
 
 		 848 aa  422  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  43.89 
 
 		 767 aa  317  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  42.69 
 
 		 1082 aa  316  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  43.43 
 
 		 851 aa  309  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  42.39 
 
 		 803 aa  299  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  57.98 
 
 		 240 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.75 
 
 		 831 aa  237  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  30.42 
 
 		 606 aa  224  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  51.21 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  35.81 
 
 		 922 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.22 
 
 		 809 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  35.37 
 
 		 847 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 649 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  36.92 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 		 814 aa  82  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  38.13 
 
 		 1016 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  40.57 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  42.99 
 
 		 700 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.41 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.43 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  52.78 
 
 		 707 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  55.56 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  54.93 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  61.76 
 
 		 630 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  49.37 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  43.82 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  40.18 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  40.74 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  40 
 
 		 511 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  51.39 
 
 		 591 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  38.55 
 
 		 471 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  27.4 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  53.23 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.85 
 
 		 842 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.96 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  49.33 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  33.94 
 
 		 747 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  52.24 
 
 		 590 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  50.65 
 
 		 710 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  36 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.11 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.29 
 
 		 790 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 619 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  40 
 
 		 1316 aa  68.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  42.06 
 
 		 683 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  48.53 
 
 		 660 aa  68.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  54.69 
 
 		 961 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  50.75 
 
 		 789 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  52.7 
 
 		 900 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  48.65 
 
 		 563 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 736 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  55.17 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  41.76 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  53.73 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  43.96 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  39.74 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  34.58 
 
 		 789 aa  65.1  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  49.25 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  50.75 
 
 		 611 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  44 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  40.45 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  52.05 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.73 
 
 		 411 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  48.68 
 
 		 965 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  50.75 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  33.96 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  43.18 
 
 		 1077 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  52.94 
 
 		 982 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  41.79 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.75 
 
 		 1051 aa  61.6  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  30.49 
 
 		 898 aa  60.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  49.28 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  41.54 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>