23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4535 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 
898 aa  1819    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0354  hypothetical protein  27.74 
 
 
725 aa  194  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4076  hypothetical protein  20.86 
 
 
917 aa  97.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2820  hypothetical protein  22.81 
 
 
915 aa  86.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  36.17 
 
 
1016 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.11 
 
 
809 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  35.16 
 
 
847 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.8 
 
 
831 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  34.65 
 
 
554 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  32.2 
 
 
511 aa  61.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  30.49 
 
 
820 aa  61.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  34.96 
 
 
649 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  32.77 
 
 
700 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  29.81 
 
 
540 aa  57.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  30.65 
 
 
401 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  33.61 
 
 
1316 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4296  carbohydrate-binding family 6 protein  31.68 
 
 
767 aa  48.9  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  29.82 
 
 
769 aa  48.9  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  34.29 
 
 
772 aa  48.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.78 
 
 
2073 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04681  putative secreted protein  29.41 
 
 
700 aa  45.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  31.13 
 
 
789 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  29.84 
 
 
749 aa  44.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>