37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2655 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 847 aa  1702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2886  hypothetical protein  41.24 
 
 		 730 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.179721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0777  hypothetical protein  24.17 
 
 		 708 aa  125  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.26 
 
 		 831 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.39 
 
 		 809 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  46.4 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  36.07 
 
 		 820 aa  108  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  52.03 
 
 		 1016 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  47.93 
 
 		 649 aa  98.6  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  39.84 
 
 		 401 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  40.65 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  36.57 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  39.81 
 
 		 772 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  43.97 
 
 		 769 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  41.44 
 
 		 1316 aa  74.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  34.71 
 
 		 914 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  40.37 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  35.16 
 
 		 898 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.06 
 
 		 2073 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  39.29 
 
 		 789 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  37.04 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  36.57 
 
 		 1000 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  36.79 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 1091 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  37.7 
 
 		 1207 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  42.73 
 
 		 434 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 628 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  29.91 
 
 		 877 aa  51.2  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  27.01 
 
 		 747 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  32.26 
 
 		 580 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  33.06 
 
 		 1128 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.85 
 
 		 790 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4296  carbohydrate-binding family 6 protein  39.77 
 
 		 767 aa  48.5  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.03 
 
 		 469 aa  47  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1167 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  29.85 
 
 		 475 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0517  raffinose synthase  28 
 
 		 675 aa  45.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.780547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>