13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4296 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4296  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 
767 aa  1582    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04681  putative secreted protein  64.86 
 
 
700 aa  947    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  29.27 
 
 
554 aa  51.2  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  34.55 
 
 
1207 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  33.72 
 
 
540 aa  50.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  31.68 
 
 
898 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  39.77 
 
 
847 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  38.78 
 
 
815 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  29.5 
 
 
1016 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 
1000 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  26.42 
 
 
2073 aa  45.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  32.31 
 
 
649 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  32.61 
 
 
511 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>