32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3331 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 
747 aa  1509    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0757  dextranase  28.78 
 
 
610 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4431  hypothetical protein  28.39 
 
 
586 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0929  hypothetical protein  28.83 
 
 
579 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.279315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  27.39 
 
 
1007 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0759  hypothetical protein  22.57 
 
 
566 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  33.97 
 
 
1000 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  36.17 
 
 
1091 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.08 
 
 
2073 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  35.1 
 
 
1128 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0653  hypothetical protein  28.36 
 
 
651 aa  69.3  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.293618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
700 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  28.32 
 
 
789 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  33.08 
 
 
628 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  31.71 
 
 
870 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  33.33 
 
 
772 aa  61.6  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  30.72 
 
 
1207 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.54 
 
 
809 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.1 
 
 
831 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  27.78 
 
 
554 aa  58.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  33.07 
 
 
649 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  32.77 
 
 
511 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  30.65 
 
 
820 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 
401 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  31.25 
 
 
574 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  32.46 
 
 
914 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  29.73 
 
 
747 aa  52  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  27.01 
 
 
847 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  27.27 
 
 
1016 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  29.46 
 
 
1316 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  28.33 
 
 
540 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  28.57 
 
 
769 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>