84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6906 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 628 aa  1263    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  28.78 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  34.48 
 
 		 2073 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.53 
 
 		 790 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  43.7 
 
 		 1000 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  25.91 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  25.91 
 
 		 300 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  26.09 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  35.38 
 
 		 1016 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04100  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.82 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  27.92 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  35.34 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  41.07 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 1332 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 		 1321 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  42.42 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  28.7 
 
 		 1918 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.75 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  33.08 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.42 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  24.69 
 
 		 477 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  23.34 
 
 		 883 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0607  Ig domain protein  35.92 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  35.51 
 
 		 1091 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.69 
 
 		 912 aa  60.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  26.69 
 
 		 330 aa  60.1  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.17 
 
 		 1694 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.84 
 
 		 884 aa  60.1  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.64 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  24.06 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.62 
 
 		 809 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.51 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  32.82 
 
 		 1128 aa  57.4  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  25.68 
 
 		 389 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 		 469 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 641 aa  55.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 642 aa  55.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  24.73 
 
 		 588 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.77 
 
 		 306 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 847 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  25.54 
 
 		 423 aa  53.9  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  23.72 
 
 		 279 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 686 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  27.5 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  26.67 
 
 		 1059 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  22.74 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  33.86 
 
 		 747 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  30 
 
 		 1207 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.97 
 
 		 315 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.01 
 
 		 288 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  23.16 
 
 		 281 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  23.3 
 
 		 274 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  36.84 
 
 		 554 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.46 
 
 		 252 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  21.86 
 
 		 328 aa  50.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  25.55 
 
 		 291 aa  50.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  26.69 
 
 		 328 aa  50.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 306 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 		 289 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  24.43 
 
 		 1441 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  24.08 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 907 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.94 
 
 		 742 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  26.14 
 
 		 319 aa  48.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 492 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  25.15 
 
 		 691 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.88 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.89 
 
 		 819 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.08 
 
 		 1290 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  34.69 
 
 		 789 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 556 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 752 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 728 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.38 
 
 		 627 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0209  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 246 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  24.39 
 
 		 426 aa  43.9  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>