171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1873 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 1091 aa  2217    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1213 aa  360  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.16 
 
 		 1410 aa  325  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  35.89 
 
 		 1000 aa  308  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.19 
 
 		 1212 aa  273  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  32.79 
 
 		 675 aa  254  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.72 
 
 		 823 aa  245  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1200 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  30.39 
 
 		 671 aa  231  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.8 
 
 		 1448 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  30.6 
 
 		 1418 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.12 
 
 		 1109 aa  214  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  46.9 
 
 		 1085 aa  204  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.61 
 
 		 584 aa  202  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  41.98 
 
 		 857 aa  174  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.58 
 
 		 933 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  28.11 
 
 		 981 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.4 
 
 		 2073 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  46.27 
 
 		 503 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  30.86 
 
 		 877 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  38.41 
 
 		 1132 aa  106  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1010  APHP domain protein  44.07 
 
 		 300 aa  104  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.51 
 
 		 982 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.9 
 
 		 790 aa  102  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  30.14 
 
 		 1391 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  36.26 
 
 		 673 aa  95.9  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  32.73 
 
 		 705 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  30.71 
 
 		 797 aa  94  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1167 aa  90.9  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  39.16 
 
 		 1207 aa  88.6  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29 
 
 		 863 aa  87.8  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  26.45 
 
 		 918 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  39.34 
 
 		 869 aa  85.1  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  40.83 
 
 		 726 aa  84.7  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  38.52 
 
 		 610 aa  82.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  41.18 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  35.37 
 
 		 870 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  35.04 
 
 		 465 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 		 719 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 		 819 aa  79  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  32.88 
 
 		 1356 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 581 aa  77.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  32.88 
 
 		 823 aa  77.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 845 aa  77  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  34.96 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.08 
 
 		 777 aa  75.5  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  30.14 
 
 		 1799 aa  75.1  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1024 aa  74.7  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  32.05 
 
 		 1380 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  31.51 
 
 		 802 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  24.41 
 
 		 627 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  24.47 
 
 		 954 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  39.5 
 
 		 639 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.73 
 
 		 972 aa  72.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  36.17 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  23.67 
 
 		 1234 aa  72.4  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  36.59 
 
 		 884 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  35.77 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  31.69 
 
 		 1128 aa  71.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  31.94 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  35.77 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  31.69 
 
 		 926 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  30.4 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  34.26 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  36.92 
 
 		 870 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  25 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  25.23 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  30.2 
 
 		 840 aa  68.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.2 
 
 		 1707 aa  68.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.96 
 
 		 957 aa  68.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  28.35 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  31.76 
 
 		 786 aa  68.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.04 
 
 		 809 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  29.58 
 
 		 801 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  28.33 
 
 		 500 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  23.73 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  33.07 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  27.89 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  33.58 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  30.22 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.37 
 
 		 1732 aa  65.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  26.21 
 
 		 735 aa  65.1  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  34.35 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  31.87 
 
 		 1295 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  25.16 
 
 		 1004 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  32.37 
 
 		 928 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  28.28 
 
 		 2554 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  34.51 
 
 		 948 aa  63.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  26.49 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  32.29 
 
 		 855 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 847 aa  62  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  28.86 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  31.97 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.79 
 
 		 6885 aa  61.6  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  28.85 
 
 		 930 aa  61.6  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  29.17 
 
 		 3295 aa  61.6  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  36.15 
 
 		 1015 aa  61.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  23.05 
 
 		 1262 aa  61.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  33.33 
 
 		 1016 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>