134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2137 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  100 
 
 
790 aa  1632    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1740  hypothetical protein  35.05 
 
 
885 aa  347  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  36.68 
 
 
809 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  36.68 
 
 
809 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  29.98 
 
 
1323 aa  220  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  33.82 
 
 
576 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  58.02 
 
 
707 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.9 
 
 
1091 aa  102  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.81 
 
 
2073 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  24.78 
 
 
748 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  50.55 
 
 
831 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  24.08 
 
 
755 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 
434 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 
1000 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  43.22 
 
 
558 aa  90.1  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  53.52 
 
 
814 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 
842 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.25 
 
 
707 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  39.53 
 
 
628 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.34 
 
 
736 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  25.43 
 
 
723 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 
660 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 
1051 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.65 
 
 
582 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  46.84 
 
 
415 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  58.21 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 
730 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  36.54 
 
 
1077 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.5 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  43.96 
 
 
484 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  36.6 
 
 
583 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  52.17 
 
 
511 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  38.46 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 
739 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 
773 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  47.62 
 
 
630 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.32 
 
 
411 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 
563 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 
619 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  33.48 
 
 
951 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  46.38 
 
 
535 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.39 
 
 
809 aa  71.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  45.12 
 
 
600 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  40.96 
 
 
710 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 
563 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
895 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.21 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  44.29 
 
 
820 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.89 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.29 
 
 
567 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  51.67 
 
 
571 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  47.89 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  35.25 
 
 
580 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  45.59 
 
 
789 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  38.03 
 
 
649 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  46.58 
 
 
477 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  44.87 
 
 
922 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  49.23 
 
 
599 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  30.87 
 
 
683 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 
580 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.69 
 
 
807 aa  64.3  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  36.76 
 
 
612 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
590 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  44.62 
 
 
982 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  40.26 
 
 
948 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.59 
 
 
537 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  33.33 
 
 
532 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  48.44 
 
 
334 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.03 
 
 
710 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  30.43 
 
 
1207 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  45.07 
 
 
928 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  37.31 
 
 
311 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 
611 aa  61.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  44.29 
 
 
928 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  30.54 
 
 
1128 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 
742 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  42.03 
 
 
870 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  49.23 
 
 
679 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  44.78 
 
 
837 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 
961 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  43.24 
 
 
554 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 
649 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36 
 
 
848 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 
566 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  40.3 
 
 
524 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  45.59 
 
 
1224 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  44.78 
 
 
639 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  30.57 
 
 
533 aa  58.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  34.29 
 
 
900 aa  57.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07117  conserved hypothetical protein  22.74 
 
 
458 aa  57.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  40.85 
 
 
621 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 
741 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  29.63 
 
 
401 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  38.55 
 
 
780 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  46.88 
 
 
949 aa  54.7  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  38.36 
 
 
435 aa  54.7  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  28.14 
 
 
490 aa  54.3  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>