More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3240 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  100 
 
 		 2073 aa  4206    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  53.14 
 
 		 1457 aa  337  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  34.33 
 
 		 1729 aa  322  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  39.04 
 
 		 609 aa  307  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  41.02 
 
 		 1000 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.99 
 
 		 631 aa  255  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  45.07 
 
 		 3320 aa  255  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  36.53 
 
 		 2375 aa  240  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  31.82 
 
 		 2286 aa  211  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.12 
 
 		 6885 aa  184  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  30.93 
 
 		 547 aa  180  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 580 aa  177  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.51 
 
 		 340 aa  176  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.1 
 
 		 505 aa  169  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.48 
 
 		 350 aa  164  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.83 
 
 		 648 aa  161  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.74 
 
 		 466 aa  159  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.96 
 
 		 376 aa  156  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.97 
 
 		 347 aa  157  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.43 
 
 		 362 aa  154  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.65 
 
 		 316 aa  153  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.56 
 
 		 316 aa  153  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.64 
 
 		 316 aa  153  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.64 
 
 		 316 aa  152  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.9 
 
 		 392 aa  151  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.34 
 
 		 316 aa  151  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.34 
 
 		 316 aa  151  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  29.34 
 
 		 316 aa  151  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  32.66 
 
 		 341 aa  150  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.03 
 
 		 369 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.53 
 
 		 315 aa  150  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.87 
 
 		 378 aa  148  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.85 
 
 		 628 aa  148  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  31.34 
 
 		 344 aa  147  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.56 
 
 		 378 aa  147  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  31.55 
 
 		 340 aa  146  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  32.89 
 
 		 2207 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 		 377 aa  142  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  30.88 
 
 		 329 aa  142  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 333 aa  139  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.5 
 
 		 353 aa  139  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  29.37 
 
 		 627 aa  138  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.34 
 
 		 314 aa  138  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 634 aa  138  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 634 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 634 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.15 
 
 		 607 aa  136  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.42 
 
 		 315 aa  135  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.97 
 
 		 333 aa  132  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.97 
 
 		 333 aa  132  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.72 
 
 		 426 aa  132  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.82 
 
 		 315 aa  127  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  31.4 
 
 		 1091 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.91 
 
 		 809 aa  124  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  27.63 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  27.56 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  27.12 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  42.95 
 
 		 1139 aa  116  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.46 
 
 		 1661 aa  115  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.6 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.78 
 
 		 517 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.54 
 
 		 982 aa  112  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 1016 aa  112  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  27.59 
 
 		 756 aa  109  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  32.44 
 
 		 548 aa  109  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  30.19 
 
 		 618 aa  108  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.55 
 
 		 507 aa  107  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1260 aa  106  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.59 
 
 		 1847 aa  100  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  31.72 
 
 		 1042 aa  100  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  29.48 
 
 		 932 aa  100  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  28.66 
 
 		 1278 aa  96.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.81 
 
 		 790 aa  96.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  30.69 
 
 		 414 aa  96.3  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  25.42 
 
 		 573 aa  95.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  41.43 
 
 		 412 aa  93.2  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  34.17 
 
 		 1495 aa  92.8  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.52 
 
 		 392 aa  90.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 491 aa  90.5  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  30.85 
 
 		 729 aa  90.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.97 
 
 		 691 aa  90.1  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.43 
 
 		 507 aa  90.1  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25.27 
 
 		 863 aa  89.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  29.33 
 
 		 524 aa  89.4  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  29.48 
 
 		 530 aa  87.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  29.49 
 
 		 820 aa  87.4  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  28.18 
 
 		 733 aa  87.4  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 		 1029 aa  86.7  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  28.74 
 
 		 861 aa  86.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.33 
 
 		 1054 aa  86.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  30.73 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  34.48 
 
 		 628 aa  85.5  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  28.74 
 
 		 859 aa  85.5  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  37.41 
 
 		 425 aa  85.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  29.44 
 
 		 2178 aa  85.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.88 
 
 		 507 aa  85.5  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  28.74 
 
 		 930 aa  84.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  30.91 
 
 		 1413 aa  84.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  29.5 
 
 		 554 aa  84.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.88 
 
 		 693 aa  84.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>