66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0791 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 607 aa  1269    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  44.66 
 
 		 627 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 634 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 634 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.67 
 
 		 628 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  45.44 
 
 		 634 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.02 
 
 		 466 aa  318  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.19 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  45.81 
 
 		 329 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.25 
 
 		 350 aa  237  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.73 
 
 		 517 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  39.84 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.44 
 
 		 376 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.46 
 
 		 340 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.17 
 
 		 347 aa  200  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  35.94 
 
 		 355 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.12 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  35.35 
 
 		 580 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.11 
 
 		 355 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  34.94 
 
 		 349 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.82 
 
 		 648 aa  170  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.12 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  32.51 
 
 		 344 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.46 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.48 
 
 		 316 aa  150  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  31.94 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.85 
 
 		 426 aa  147  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.27 
 
 		 316 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.27 
 
 		 316 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.27 
 
 		 316 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.27 
 
 		 316 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  31.95 
 
 		 316 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.5 
 
 		 392 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  31.75 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.39 
 
 		 315 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.06 
 
 		 378 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.06 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 316 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.57 
 
 		 2073 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 377 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.73 
 
 		 333 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.73 
 
 		 333 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  29.39 
 
 		 333 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.06 
 
 		 314 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 		 1278 aa  90.5  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.98 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.23 
 
 		 384 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  23.68 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.63 
 
 		 393 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  23.49 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.57 
 
 		 334 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  21.98 
 
 		 699 aa  53.9  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  26.76 
 
 		 672 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  30.4 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  25.42 
 
 		 468 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  23.13 
 
 		 855 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.11 
 
 		 383 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  24.11 
 
 		 319 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.7 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  29.57 
 
 		 497 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  24.21 
 
 		 464 aa  43.9  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>