58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0501 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 426 aa  876    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.67 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  53.02 
 
 		 580 aa  345  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.47 
 
 		 316 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.95 
 
 		 316 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.73 
 
 		 648 aa  322  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.3 
 
 		 378 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.15 
 
 		 378 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  49.06 
 
 		 316 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.74 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.74 
 
 		 316 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.37 
 
 		 392 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.43 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  46.41 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.43 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  50.65 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.78 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  50.47 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.31 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  48.81 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.2 
 
 		 314 aa  296  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.2 
 
 		 315 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  47.34 
 
 		 341 aa  283  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.92 
 
 		 315 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.52 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.52 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  39.82 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.2 
 
 		 340 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.71 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.77 
 
 		 350 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.5 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  33.52 
 
 		 355 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.09 
 
 		 607 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.92 
 
 		 628 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.44 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.14 
 
 		 355 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.58 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  32.92 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 634 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 634 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 634 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  32.34 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  31.05 
 
 		 627 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.05 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.48 
 
 		 2073 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.37 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  28.29 
 
 		 1278 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  25.78 
 
 		 710 aa  76.6  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.17 
 
 		 713 aa  60.1  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.89 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.43 
 
 		 334 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.46 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.06 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>