64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2053 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 315 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  94.6 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  67.3 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.98 
 
 		 315 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.91 
 
 		 316 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  60.19 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  60.19 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.39 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  59.87 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  59.55 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  59.87 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  54.66 
 
 		 580 aa  360  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.7 
 
 		 648 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.42 
 
 		 505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  55.45 
 
 		 362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  53.02 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.61 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.29 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  52.48 
 
 		 377 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  51.58 
 
 		 340 aa  318  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.49 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  48.94 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.5 
 
 		 392 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.63 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.63 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  52.61 
 
 		 344 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.03 
 
 		 426 aa  286  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.48 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.99 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.03 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.45 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.75 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  34.38 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.92 
 
 		 628 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.9 
 
 		 517 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  33.78 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 607 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  33.02 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.22 
 
 		 507 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  31.27 
 
 		 627 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.72 
 
 		 466 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 634 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 634 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 634 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.83 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.61 
 
 		 2073 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 		 502 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  24.37 
 
 		 710 aa  76.6  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  25.5 
 
 		 1278 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.13 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.21 
 
 		 699 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.91 
 
 		 713 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.5 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.11 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  21.26 
 
 		 855 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  19.26 
 
 		 516 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 		 510 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  29.82 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  22 
 
 		 497 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 384 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>