More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3247 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  100 
 
 		 2375 aa  4839    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  52.28 
 
 		 609 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  45.07 
 
 		 3320 aa  352  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  45.03 
 
 		 1457 aa  321  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  36.53 
 
 		 2073 aa  241  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  27.57 
 
 		 1016 aa  240  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.6 
 
 		 631 aa  204  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  33.59 
 
 		 1729 aa  201  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.29 
 
 		 6885 aa  164  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  28.68 
 
 		 2207 aa  141  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  30.34 
 
 		 547 aa  132  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35.36 
 
 		 1042 aa  111  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.46 
 
 		 1661 aa  108  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  27.21 
 
 		 2286 aa  104  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1260 aa  102  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  36.63 
 
 		 729 aa  101  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.05 
 
 		 1847 aa  99.8  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  25.73 
 
 		 618 aa  91.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  30.93 
 
 		 548 aa  90.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.31 
 
 		 1016 aa  88.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  25.06 
 
 		 756 aa  88.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  29.79 
 
 		 414 aa  85.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 710 aa  84.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  25.77 
 
 		 1495 aa  84  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  29.47 
 
 		 506 aa  83.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  30.57 
 
 		 779 aa  82.8  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.67 
 
 		 926 aa  82.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  28.42 
 
 		 733 aa  82  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  30.9 
 
 		 1013 aa  81.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.39 
 
 		 533 aa  81.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  29.34 
 
 		 930 aa  81.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.39 
 
 		 533 aa  81.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.52 
 
 		 539 aa  80.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 1054 aa  80.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  30.68 
 
 		 2178 aa  80.1  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  31.89 
 
 		 506 aa  80.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  28.14 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  29.44 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  29.89 
 
 		 693 aa  79.3  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.6 
 
 		 843 aa  79.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  30.56 
 
 		 1226 aa  79  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.57 
 
 		 558 aa  79  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  31.15 
 
 		 413 aa  78.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  26.74 
 
 		 530 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.96 
 
 		 567 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.27 
 
 		 572 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  29.32 
 
 		 573 aa  77.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  29.59 
 
 		 413 aa  78.2  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  30.39 
 
 		 669 aa  77.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 518 aa  77.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  28.41 
 
 		 921 aa  77.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.28 
 
 		 1821 aa  76.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.73 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  30.39 
 
 		 1081 aa  75.9  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.24 
 
 		 1029 aa  75.9  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  28.42 
 
 		 4630 aa  74.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  32.31 
 
 		 880 aa  74.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  26.29 
 
 		 814 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  30.29 
 
 		 579 aa  74.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  26.29 
 
 		 814 aa  74.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  26.29 
 
 		 814 aa  74.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  25.86 
 
 		 807 aa  73.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  27.84 
 
 		 410 aa  73.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  25.99 
 
 		 527 aa  73.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  23.7 
 
 		 862 aa  73.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.42 
 
 		 1009 aa  73.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  23.7 
 
 		 862 aa  73.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  27.91 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.02 
 
 		 995 aa  73.2  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  30.46 
 
 		 876 aa  73.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  27.12 
 
 		 758 aa  72.8  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  31.61 
 
 		 920 aa  72.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.12 
 
 		 397 aa  72  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  29.31 
 
 		 625 aa  72.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.12 
 
 		 348 aa  72  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.01 
 
 		 414 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  23.78 
 
 		 822 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 		 414 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  27.12 
 
 		 579 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.14 
 
 		 540 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  29.38 
 
 		 548 aa  71.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  28.09 
 
 		 457 aa  71.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  25 
 
 		 414 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  25.58 
 
 		 413 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  27.12 
 
 		 578 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 		 414 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  27.01 
 
 		 414 aa  70.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.19 
 
 		 692 aa  71.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  25.86 
 
 		 914 aa  70.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  22.67 
 
 		 861 aa  70.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  27.62 
 
 		 624 aa  70.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  26.11 
 
 		 1174 aa  70.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  29.55 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.33 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  29.57 
 
 		 754 aa  69.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.33 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  23.12 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.33 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  27.12 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  27.65 
 
 		 932 aa  69.7  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>