82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2050 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 628 aa  1320    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  78.86 
 
 		 634 aa  1078    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  86.44 
 
 		 627 aa  1156    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  79.18 
 
 		 634 aa  1082    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  79.34 
 
 		 634 aa  1083    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  46.67 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.42 
 
 		 466 aa  287  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.51 
 
 		 353 aa  243  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  41.53 
 
 		 329 aa  240  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.37 
 
 		 340 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  40.11 
 
 		 502 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.51 
 
 		 350 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.84 
 
 		 376 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2200  alpha-N-arabinofuranosidase  88.39 
 
 		 112 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.82 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2308  alpha-N-arabinofuranosidase  84.82 
 
 		 112 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.98 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.53 
 
 		 347 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  36 
 
 		 355 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  34.64 
 
 		 580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.23 
 
 		 648 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  33.63 
 
 		 355 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  34.73 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  33.13 
 
 		 344 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.76 
 
 		 316 aa  147  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.66 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.6 
 
 		 315 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.92 
 
 		 315 aa  143  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.59 
 
 		 426 aa  143  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  31.35 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  33.14 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  31.35 
 
 		 316 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  31.35 
 
 		 316 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  31.35 
 
 		 316 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  31.35 
 
 		 316 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.94 
 
 		 316 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.65 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  32.63 
 
 		 340 aa  141  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.91 
 
 		 2073 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.07 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.87 
 
 		 369 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.39 
 
 		 378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.39 
 
 		 378 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.28 
 
 		 315 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 377 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.25 
 
 		 314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.86 
 
 		 333 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.86 
 
 		 333 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  27.32 
 
 		 1278 aa  97.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  26.43 
 
 		 672 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  23.53 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.14 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  25.19 
 
 		 963 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  27.78 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  22.36 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.1 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.39 
 
 		 304 aa  57  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  20.17 
 
 		 487 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  27.54 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  28.68 
 
 		 566 aa  54.3  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  22.56 
 
 		 491 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.81 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  29.13 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  25 
 
 		 1413 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 340 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  20.89 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.78 
 
 		 507 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  25.25 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 691 aa  47.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  23.97 
 
 		 412 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  24.48 
 
 		 495 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  24.34 
 
 		 401 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.18 
 
 		 306 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  23.36 
 
 		 514 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  25.18 
 
 		 982 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 310 aa  45.8  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  21.69 
 
 		 393 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  26.06 
 
 		 411 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25.9 
 
 		 863 aa  44.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>