14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2200 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2200  alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 112 aa  235  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  97.32 
 
 		 627 aa  229  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2308  alpha-N-arabinofuranosidase  93.75 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  88.39 
 
 		 628 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  75 
 
 		 634 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  74.11 
 
 		 634 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  74.11 
 
 		 634 aa  176  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.44 
 
 		 474 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.56 
 
 		 672 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.56 
 
 		 520 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  25 
 
 		 607 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  26.13 
 
 		 582 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 		 495 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.21 
 
 		 1139 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>