46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1544 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  100 
 
 		 710 aa  1451    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.82 
 
 		 316 aa  107  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  29.11 
 
 		 344 aa  99.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.25 
 
 		 316 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.97 
 
 		 316 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.97 
 
 		 316 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.69 
 
 		 316 aa  90.5  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  26.69 
 
 		 316 aa  90.5  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.65 
 
 		 362 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.17 
 
 		 316 aa  88.6  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.04 
 
 		 314 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  26.39 
 
 		 341 aa  83.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  27.51 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.56 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.42 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.05 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.23 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.78 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.37 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.35 
 
 		 648 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.37 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 		 333 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  32.17 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  24.54 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.35 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.35 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.87 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.14 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.17 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.78 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.07 
 
 		 466 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.37 
 
 		 376 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 		 369 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.31 
 
 		 347 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.62 
 
 		 353 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.91 
 
 		 355 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  23.84 
 
 		 329 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.25 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.46 
 
 		 507 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 345 aa  45.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  19.86 
 
 		 355 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.7 
 
 		 517 aa  43.9  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>