61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2077 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  95.49 
 
 		 378 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  94.69 
 
 		 378 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 377 aa  782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.64 
 
 		 369 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  70.92 
 
 		 392 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  51.25 
 
 		 580 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.12 
 
 		 648 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  53.59 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.47 
 
 		 315 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.48 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.98 
 
 		 316 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.87 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.83 
 
 		 315 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  48 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.23 
 
 		 316 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.95 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.59 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.59 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  47.91 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.68 
 
 		 314 aa  306  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  46.47 
 
 		 344 aa  292  8e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 333 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.79 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.79 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  43.89 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  44.34 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.56 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.28 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.15 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.99 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  32.88 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.58 
 
 		 507 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.74 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.45 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.24 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.99 
 
 		 628 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.73 
 
 		 2073 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.43 
 
 		 607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 627 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  31.87 
 
 		 502 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 634 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 634 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 634 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  30.77 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.38 
 
 		 517 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  23.58 
 
 		 1278 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  24.54 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.17 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.55 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.53 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  23.71 
 
 		 713 aa  49.7  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  22.87 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  20.9 
 
 		 699 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  20.56 
 
 		 545 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>