70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  100 
 
 		 341 aa  699    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  72.11 
 
 		 340 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  54.55 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.65 
 
 		 316 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.46 
 
 		 314 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  52.7 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  53.02 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  52.7 
 
 		 316 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  52.7 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  52.7 
 
 		 316 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.02 
 
 		 315 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  53.14 
 
 		 580 aa  332  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.7 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.06 
 
 		 315 aa  324  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.35 
 
 		 648 aa  322  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.42 
 
 		 316 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.84 
 
 		 505 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  47.44 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.19 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.87 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.6 
 
 		 426 aa  278  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.1 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.1 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  44.34 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.95 
 
 		 392 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.69 
 
 		 369 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.56 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.09 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.77 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.77 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.09 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.83 
 
 		 466 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  32.84 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.14 
 
 		 628 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.49 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.14 
 
 		 2073 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  33 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.75 
 
 		 607 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 634 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 634 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 634 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  32.28 
 
 		 627 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.68 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  33.24 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.8 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 502 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 1278 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  26.39 
 
 		 710 aa  83.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.17 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  22.98 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.94 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 		 522 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.38 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.23 
 
 		 524 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.25 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.79 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.28 
 
 		 713 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.72 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  21.34 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 512 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  24.28 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.71 
 
 		 540 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  22.06 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  23.37 
 
 		 535 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>