77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2025 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 376 aa  780    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.82 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.07 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.54 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.44 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.32 
 
 		 507 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.16 
 
 		 466 aa  246  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 634 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.45 
 
 		 628 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 		 634 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  39.76 
 
 		 627 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  39.04 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  39.94 
 
 		 580 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.12 
 
 		 353 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  37.3 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.94 
 
 		 648 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.5 
 
 		 316 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  37.46 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.31 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  36 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  35.98 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  37.07 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  37.07 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  37.07 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  37.07 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  36.76 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  37.38 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.78 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.29 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.53 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.79 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.96 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.47 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.71 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  32.72 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  35.29 
 
 		 502 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.2 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.22 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  37.91 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.44 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.15 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.15 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.91 
 
 		 2073 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  28.45 
 
 		 1278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  27.16 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.53 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.35 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.08 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  23.55 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  22.46 
 
 		 525 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0316  hypothetical protein  60 
 
 		 97 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0126894  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.15 
 
 		 510 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  23.37 
 
 		 710 aa  52.8  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  26.46 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.24 
 
 		 501 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  22.22 
 
 		 699 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  21.88 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.15 
 
 		 545 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.37 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  25.29 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.11 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.22 
 
 		 327 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.09 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  23.6 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 537 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>