74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3926 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 353 aa  718    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.46 
 
 		 466 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  42.37 
 
 		 607 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  40.79 
 
 		 627 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  39.15 
 
 		 634 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  39.15 
 
 		 634 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  38.87 
 
 		 634 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.97 
 
 		 628 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.81 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  37.19 
 
 		 329 aa  216  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  39.2 
 
 		 502 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.17 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.97 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.91 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.79 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.51 
 
 		 507 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 580 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.87 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  34.73 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.12 
 
 		 648 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  35.1 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.27 
 
 		 505 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  33.44 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.7 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.7 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.7 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.7 
 
 		 316 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.94 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.7 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.55 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.6 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.57 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.12 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  32.2 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.96 
 
 		 2073 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.64 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  30.68 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.27 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.09 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.83 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.45 
 
 		 426 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.6 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.6 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.13 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.21 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  28.72 
 
 		 1278 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.23 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.97 
 
 		 713 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.34 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  21.73 
 
 		 699 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  26.62 
 
 		 710 aa  53.1  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 644 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.8 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.7 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 		 487 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  22.9 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  22.8 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  22.71 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  27.27 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.83 
 
 		 524 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  23.53 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  24.57 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  23.48 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.19 
 
 		 495 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>