79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1996 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  79.34 
 
 		 628 aa  1083    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  98.42 
 
 		 634 aa  1310    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  78.71 
 
 		 627 aa  1074    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  98.42 
 
 		 634 aa  1311    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 634 aa  1330    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  45.28 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.39 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.51 
 
 		 353 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  41.85 
 
 		 329 aa  238  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.82 
 
 		 350 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.18 
 
 		 340 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.26 
 
 		 376 aa  217  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  37.6 
 
 		 502 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.26 
 
 		 507 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.8 
 
 		 347 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.1 
 
 		 517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.12 
 
 		 355 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2200  alpha-N-arabinofuranosidase  75 
 
 		 112 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  32.8 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2308  alpha-N-arabinofuranosidase  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  35.33 
 
 		 349 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.14 
 
 		 648 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.68 
 
 		 362 aa  144  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.55 
 
 		 392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  33.53 
 
 		 344 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.5 
 
 		 316 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.7 
 
 		 316 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.94 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.94 
 
 		 316 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  32.28 
 
 		 341 aa  138  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  31.94 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.94 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.63 
 
 		 316 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.63 
 
 		 316 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.33 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.64 
 
 		 315 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.85 
 
 		 315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.97 
 
 		 315 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.39 
 
 		 369 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.68 
 
 		 378 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  25.16 
 
 		 2073 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.17 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.07 
 
 		 378 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.85 
 
 		 314 aa  114  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.5 
 
 		 333 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.5 
 
 		 333 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 333 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  25.92 
 
 		 1278 aa  90.9  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  24.64 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.2 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.91 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  23.26 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  30.77 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  20.77 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.61 
 
 		 566 aa  54.3  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.15 
 
 		 474 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  21.76 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  29.41 
 
 		 582 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.78 
 
 		 520 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  23.37 
 
 		 340 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  27.92 
 
 		 963 aa  50.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 306 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  25.56 
 
 		 1413 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  28.85 
 
 		 436 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.89 
 
 		 334 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.73 
 
 		 691 aa  47.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  27.14 
 
 		 863 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.37 
 
 		 507 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 345 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  22.97 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.25 
 
 		 319 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  23.77 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  25.93 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0316  hypothetical protein  34.69 
 
 		 97 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0126894  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  25.34 
 
 		 412 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 319 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>