84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3395 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 355 aa  733    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  64.84 
 
 		 349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.94 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.57 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.06 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.08 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.76 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.9 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.02 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.94 
 
 		 607 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.84 
 
 		 517 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 634 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 580 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.12 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  32.97 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 634 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 634 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  33.43 
 
 		 627 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.63 
 
 		 628 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.16 
 
 		 648 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  34.76 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.83 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  34.65 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.05 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.25 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.7 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.14 
 
 		 426 aa  149  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  30.86 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.81 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.81 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.23 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.81 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  32.49 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.02 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.67 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.08 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.91 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  33.24 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.7 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.7 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.5 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.5 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.89 
 
 		 378 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.57 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  26.85 
 
 		 2073 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 1278 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.19 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.1 
 
 		 510 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  23.17 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.36 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.44 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  24.01 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  22.38 
 
 		 713 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.59 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.1 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  24.42 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 		 699 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.75 
 
 		 522 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  22.91 
 
 		 487 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  22.44 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  23.84 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 572 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  22.47 
 
 		 503 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  23.1 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  20.45 
 
 		 537 aa  50.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  22.81 
 
 		 472 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 644 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  22.53 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 		 855 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.1 
 
 		 540 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.36 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 		 536 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.97 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 532 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  19.86 
 
 		 710 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  22.67 
 
 		 545 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.77 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>