41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3207 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 337 aa  687    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.09 
 
 		 648 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  44.19 
 
 		 293 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  38.19 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  40.26 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  36.13 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.11 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  26.81 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  21.6 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  24.91 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  26.23 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 		 512 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.18 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  22.67 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  22.49 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  27.97 
 
 		 1186 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.78 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  22.13 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  23.4 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 		 534 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  25.66 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  22.37 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  24.78 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  22.09 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 537 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.77 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 636 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  24.53 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 644 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  22.28 
 
 		 699 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.46 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  22.95 
 
 		 679 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>