26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2654 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 299 aa  604  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  46.88 
 
 		 293 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  40.26 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.64 
 
 		 648 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  36.65 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  34.41 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.12 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  20.92 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.1 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.48 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  22.03 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.94 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.94 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.09 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.48 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.18 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  21.98 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  25.34 
 
 		 598 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.62 
 
 		 393 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.76 
 
 		 466 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  23.2 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  21.58 
 
 		 384 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.72 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  24.79 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>