230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2392 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 306 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  53.95 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  47.19 
 
 		 345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  42.14 
 
 		 348 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  38.49 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  39.16 
 
 		 456 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  35.67 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  36.5 
 
 		 472 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  34.25 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  37.07 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  33.61 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  34.75 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  35.34 
 
 		 524 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  34.08 
 
 		 522 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  30.98 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 		 376 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  31.86 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  33.08 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  30.79 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  33.58 
 
 		 487 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  31.72 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 345 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  30.88 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  31.2 
 
 		 713 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.68 
 
 		 501 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  29.66 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  28.82 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.88 
 
 		 510 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.45 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 465 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.39 
 
 		 644 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  32.14 
 
 		 509 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.09 
 
 		 503 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  30.33 
 
 		 537 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  26.3 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 		 699 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.64 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  27.69 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  33.63 
 
 		 468 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  24.72 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.83 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 572 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 543 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28.17 
 
 		 566 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.05 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.47 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  28.78 
 
 		 550 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 532 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.69 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.25 
 
 		 829 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.07 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 		 560 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.62 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  27.04 
 
 		 517 aa  69.3  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.17 
 
 		 519 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.7 
 
 		 536 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.62 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.35 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 855 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.36 
 
 		 707 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  24.15 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  27.31 
 
 		 532 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  25.18 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  28.47 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  25.76 
 
 		 524 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 586 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 		 551 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 563 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.15 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.76 
 
 		 515 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  25.18 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.85 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  27.52 
 
 		 527 aa  65.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  27.51 
 
 		 533 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  25.39 
 
 		 804 aa  65.9  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.4 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.31 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.11 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.03 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.74 
 
 		 538 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  25.58 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  25.27 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>